Історія Комаргородського вищого професійного училища починається з 1973 року, коли на базі сільськогосподарського технікуму було реорганізовано Комаргородське ССПТУ-39 (Наказ № 44/276 Державного комітету по професійно-технічній освіті Української РСР від 21 червня 1973 року). Його повна назва була „Середнє сільське професійно-технічне училище №39”.
З 1977 р. по 1985 р. були відкриті такі спеціальності:
- оператор машинного доїння;
- будівельник сільськогосподарського виробництва;
- електромонтер с/г, слюсар по ремонту автотранспорту;
- лаборант хіміко-бактеріологічного аналізу.
У 1984 році в зв’язку з реорганізацією ССПТУ-39 було перейменовано в СПТУ - 39. Після у 1984 р. були відкриті нові спеціальності:
- електрогазозварник;
- водій автомобіля;
- кухар, кондитер;
- бухгалтер с/г виробництва.
У жовтні 1989 р. в зв’язку з реорганізацією СПТУ - 39 перейменовано в ПТУ - 39 (Наказ № 165 від 28.10.89 р.). Після цього училище готувало спеціалістів із слідуючих професій:
- бухгалтер, плодоовочівник;
- кухар, кондитер;
- тракторист-машиніст с/г виробництва категорії „А, В, С”, слюсар-ремонтник с/г обладнання 3 розряду, водій автомобіля 3,2,1 класу (важкі вантажні автомобілі з великою вантажопідйомністю та вантажні автомобілі) категорії „С”;
- електрозварник, водій автомобіля 3,2,1 класу (важкі вантажні автомобілі з великою вантажопідйомністю та вантажні автомобілі) категорії „С”.
- оператор комп’ютерного набору, обліковець (реєстрація бухгалтерських даних )”.
В зв’язку з наступною реорганізацією у 2003 році Комаргородське ПТУ - 39 було перейменовано в Комаргородський професійний аграрний ліцей Вінницької області (Наказ № 22 від 14.03.2003 р.).
У 2015 році відповідно до наказу Міністерства освіти і науки України №351 від 24.03.2015 року змінено тип Комаргрордського професійного аграрного ліцею Вінницької області на Комаргородське вище професійне училище.
В 2016 році відповідно до наказу Міністерства освіти і науки України №1487 від 19.12.2016 року до Комаргородського ВПУ приєднано ДНЗ ПТУ №35 с. Ольгопіль Чечельницького району.
Станом на 1 вересня 2018 року в училищі навчається 15 груп за регіональним замовленням та дві групи курсової підготовки.
Училище здійснює первинну професійну підготовку за такими професіями:
На базі 9 класів
1. Тракторист-машиніст сільськогосподарського виробництва (категорії «А1, А2, В1, В2, В3»). Слюсар з ремонту сільськогосподарських машин та устаткування. Водій автотранспортних засобів (категорія «С»)
2. Електрогазозварник. Водій автотранспортних засобів (категорія «С»)
3. Кухар. Кондитер
4. Електромонтер з ремонту та обслуговування електроустаткування. Водій автотранспортних засобів (категорія «С»)
На базі 11 класів
1. Електрогазозварник. Водій автотранспортних засобів (категорія «С»)
Наш навчальний заклад вже понад 40 років готує висококваліфікованих фахівців сільськогосподарської власності і має відповідні ліцензії на надання освітніх послуг. Щорічно на навчання приймається 135 учнів за регіональним замовленням.
На сьогоднішній день в училищі навчається майже 400 учнів за регіональним замовленням та 50 слухачів, які направлені від служби зайнятості та як фізичні особи.
За роки діяльності училища підготовлено більш 12 тисяч кваліфікованих робітників та більше 2 тисяч слухачів.
На належному рівні була проведена випускна компанія. Диплом кваліфікованого робітника отримали 181 учень, у тому числі вісім дипломівз відзнакою.
Працевлаштовано 135 учнів, 10 учнів продовжують навчання, що становить 77% від загальної кількості випускників. Випущено також 71 слухач за професією «Тракторист-машиніст сільськогосподарського виробництва (категорії «А1») з них 14 слухачів для Томашпільського центру зайнятості.
Училище являє собою цілісний навчально-виробничий та виховний комплекс. До якого входять: навчальний корпус, гуртожиток, адміністративно-побутовий корпус (їдальня, спортивний зал, актовий зал та диско зал), навчально-виробничі майстерні та лабораторії.
Навчальні кабінети та лабораторії забезпеченні сучасним навчально-методичним та матеріальним обладнанням. В училищі є 25 навчальних кабінетів, 10 навчальних лабораторій, 5 майстерень, 15 тракторів різного класу і типів, 7 навчальних автомобілів, 3 зернозбиральних комбайни. В 2018 році придбано два трактори NEWHOLLAND 2030 і трактор МТЗ 320.4, два оборотних плуга, дискова борона і фреза. Навчальні кабінети та лабораторії підключенні до інтернету та бездротового зв’язку.
Цілісний майновий комплекс училища розташований на земельній ділянці загальною площею 21 га. Училище в своєму розпорядженні за межами населеного пункту має 741,3 га землі для дослідницьких і навчальних цілей, із них 645,3 га одної, власний автотрактодром площею 2,5 га.
Всі 8 полів засіяно зі збереженням сівозмін, вчасно проходять обробіток і повний цикл сільськогосподарських робіт із застосуванням сучасної сільськогосподарської техніки, яка надається інвестором-замовником кадрів, а саме МТЗ-1025, МТЗ-1025, МТЗ-1221, ТЯ-200 Ярило, ХТЗ, JonhDeere-4720 NEWHOLLAND, CaselHDX25E.